Sacha, Pikachu et leurs amis traversent une forêt en se rendant à la Ligue Johto. Ils découvrent un jeune garçon inconscient et un mystérieux Pokémon légendaire, Célébi, qui a le pouvoir de voyager à travers le temps ! Mais au cours de leur voyage dans le temps, ils sont poursuivis par un des plu...