Nicolas Sarutobi (Nikumaru en VO) est un jeune garçon qui rêve de devenir un grand espion international. C'est pour y parvenir qu'il s'est inscrit à l'Académie des Ninjas, une des écoles les plus réputées du Japon. Il est amoureux fou de Mandoline (Mako), la fille du directeur de l'école....
